Nam Lợi có vị trí giao thông tương đối thuận lợi. Nằm cách thị trấn Nam Giang khoảng 8 km. Cách thị trấn Cổ Lễ khoảng 3 km theo trục Tỉnh lộ ĐT 487. Cách thị trấn Cát Thành khoảng 4 km theo trục đường huyện lộ Nam Ninh Hải. Nằm cách thành phố Nam Định khoảng 20 km theo trục đường quốc lộ 21.
Tỉnh lộ ĐT 487 (tên cũ là đường đen) là tuyến đường giao thông huyết mạch của xã. Tỉnh lộ ĐT 487 nối xã Nam Lợi với thị trấn Cổ Lễ và các xã khác trong huyện như xã Nam Thanh, xã Nam Tiến, xã Đồng Sơn. Tỉnh lộ ĐT 487 nối xã Nam Lợi với các huỵên Trực Ninh, Nghĩa Hưng và Ý Yên; nối xã Nam Lợi với Quốc lộ 21, quốc lộ 37B và tỉnh lộ ĐT 490c. Hiện nay tỉnh lộ ĐT 487 đang được nâng cấp thành đường cấp III đồng bằng với lòng đường 9m, Vỉa hè mỗi bên 2m; với điểm đầu là đêsông Hồng (xã Trực Chính, huyện Trực Ninh) và điểm cuối là phà Đống Cao (Quốc lộ 37B - xã Yên Lộc, huyện Ý Yên).
Đường Đen chia đôi hai xã Nam Lợi (cũ) và Nam Quan (cũ). Xã Nam Lợi (cũ) nằm ở phía nam Đường Đen và Xã Nam Quan(cũ) nằm ở phía bắc Đường Đen.
Ngoài ra còn có một số trục đường liên huyện khác như:
Huyện lộ Nam Ninh Hải nối từ Tỉnh lộ ĐT 485B (đường Vàng, cũ) (Xã Nam Hồng) tới tỉnh lộ ĐT488B (đường 53A, cũ) (Xã Trực Đạo).Tuyến đường chạy qua các thôn Hồng Ninh, Hồng Long, Phú Bình, Liên Tỉnh của xã Nam Hồng; Thôn Trí An của xã Nam Hoa; thôn Bình Yên, Xối Tây của xã Nam Thanh; thôn Đô Đò, Niên Bách,Duyên Hưng, Ngọc Tỉnh, Biên Hòa của xã Nam Lợi và xã Trực Đạo của huyện Trực Ninh. Đường đã được huyện đầu tư nâng cấp lại.
Huyện lộ Hoa Lợi Hải nối từ huyện lộ Đường Trắng (Xã Nam Hoa) tới Xã Nam Hải.Tuyến đường chạy qua các thôn Hưng Đễ của xã Nam Hoa; thôn Đô Đò, Đô Thượng, Vĩnh Thượng, Đô Hạ,Đô Quan,Vĩnh TrungHạ, Duyên Hưngcủa xã Nam Lợi; thôn Hải An, Trang Hậu của xã Nam Hải. Tuyến đường đang được huyện đầu tư nâng cấp thành đường cấp IV đồng bằng với lòng đường 7m, Vỉa hè mỗi bên 1m.